順治十八年，大清江山初定，人才極缺。順治和康親王正為此事焦慮，八歲的玄燁（康熙）在一旁出主意：“何不在前朝上千舉子中選幾個能人，為我大清所用呢！”
　　前朝副榜貢生于成龍因皇子的這句話，便做了廣西羅城的知縣。他典房賣地，抹淚別了老母、妻兒，帶著四個鄉下小子上任了。
　　羅城的前幾任縣官都被盜匪砍了頭，城中百姓，無人敢搭理新縣官。匪首李吉趁他還未立穩腳跟，連下毒手：火燒縣衙殘殺仆役，短短幾天，四個仆人兩死一瘋，生死關頭，于成龍向知府借兵，設計將李吉擒獲新殺。于成龍又和仆人朝卿到瑤人侗人居住的寨子，苦苦相勸，軟硬兼施，終于化解了民族矛盾，穩住了陣腳。羅城的局面大大改變。不料，他費盡心機為百姓借來的種子和耕牛，一夜之間被掛錦縣的盜賊馬胡子搶劫一空，桂錦縣令胡神不但不還東西反而日出狂言，被逼無奈的于成龍率鄉勇越界征討，奪回自家的耕牛和種子。胡坤的黑狀告到了巡撫衙門。廣西巡撫金光祖突然來到羅城要見識一下膽大包大的于成龍。正趕上于成龍為朝庭收兌稅銀。不想瑤侗百姓一番哭訴，巡撫大人便對于成龍刮目相看。于成龍升為湖北黃州的同知。臨行前他把所積銀兩，分給孤寡老人和義學堂，帶著仆人朝卿悄悄離開了羅城。
　　號稱魚米之鄉的黃州，日子并不好過，州縣偷盜成風。為打探盜匪下落，于成龍帶著朝卿裝扮成生意人，夜闖鴻蒙寺。不想被銅鐵頭等賊人扣在大缸下，幸被民女翠兒搭救，隨將盜匪一網打盡。黃州知府的貼身仆人打著知府的旗號，來于成龍這里，蠻橫無禮索要鴨子，被于成龍痛打了一頓。眼看大禍臨頭，不料，一夜之間知府大人卻被人殺死在相好家中。在神秘的寺廟里，于成龍見到了溫文爾雅的殺人兇手一張大鵬，并將其擒獲。
　　吳三桂反叛，攻入湖南。清軍在武昌集結。危難之時于成龍被提升為武昌知府。當地一個勞軍的姑娘被總兵李國棟的小舅子張富貴奸污，姑娘投湖自盡。于成龍將罪犯抓進大字。李國棟挾持巡撫張朝珍，逼于成龍放人。情急之下，于成龍在牢房立斬張富貴。從此，李、于之間仇怨深結。尚貝勒大將軍下令讓于成龍三日內造好一座軍橋，眼看軍橋大功告成。忽聞蒲圻縣令楊彥城要棄城而逃，于成龍趕到蒲圻，當場將其正法，并用計誘敵入城，殲敵數千，穩住了戰局。當他返回架橋工地時，百年不遇的洪水傾刻間將軍橋沖垮。李國棟為報私仇，借機向朝廷告黑狀。一道圣旨，于成龍慘遭革職，他本想回老家了此余生，巡撫張朝珍苦苦挽留。為報知遇之恩，于成龍身著布衣智闖匪巢，接連攻破十幾處匪寨。于成龍不勞軍隊，不費國銀，瓦解十萬反賊的捷報震驚朝野。康熙又把于成龍升為福建按察使。
　　在福州街頭，幾十個小叫花子橫沖直撞，細問才知他們的家人受海匪案誅連被關進死牢。于成龍面見康親王，要求重審舊案，放了那些無辜百姓，遭到回絕。他一怒之下，要撞柱殉節，康親王只好應允。于成龍讓三十多個街頭孤兒在衙門里吃住了幾個月，用盡了積蓄。仆人朝卿沒米下鍋，只好當掉冬衣，被康親王發現，朝卿無奈說出實情。康親王收起當票，故意逼于成龍買酒請客，于成龍身無分文，窘態萬分，卻贏得康親王敬重。他把當票呈到皇帝面前。不久于成龍做了直隸巡嫵。
　　直隸官場風氣敗壞，保定同知錢均明目張膽養妓女，吃花酒，被微服察訪的于成龍撞著，不知好歹的錢均在大堂上強詞奪理，被于成龍摘去了頂戴花翎。
　　為嚴禁火耗一事，于成龍與布政使索倫爭執不下，索倫拂袖而去。微服出巡的康熙在巡撫大堂，看于成龍將一樁撲朔迷離的嫁妝案審得清清爽爽，不由得擊掌稱贊。
　　直隸旱災嚴重，于成龍將自己的糧米都捐了，奄奄一息的饑民仍在他面前哀哀求食，萬般無奈，他含淚將張如珍送的棗紅馬殺了，讓百姓充饑。餓暈在路上的于成龍回到府上，摘下官帽冒死罪開倉放賑。
　　康熙被子成龍的耿耿忠心所感動，將自己的銀狐皮衣給于成龍穿上，并賞千兩紋銀準他回家葬母。索倫、李國棟狼狽為奸，借口有人告于成龍拉著貪占的寶物回鄉，強行查抄于的行裝，不料搜出于成龍在各地做官時收集的十幾壇黃土。結果，康熙將索倫發配到新疆伊梨，李國棟被休官回鄉。
　　于成龍因禍得福，升為兩江總督。為保四方平安，他一到任便懸賞捉拿作惡多端的江湖飛賊魚殼。魚殼仗著救過皇帝的親外甥，竟夜潛府衙盜走賞銀。魚殼被擒，皇帝的親外甥喀禮跑到江寧文化府大堂要人，被知府陳嚴龍拒絕，喀禮狂殺陳嚴龍，于成龍怒拍驚堂木，當場斬殺了皇帝的親外甥喀禮。不久，于成龍積勞成疾、病歿在兩江總督任上。
　　于成龍病逝后，民罷市聚哭，家繪像祀之。二十年后，康熙視江南，人們仍念念不忘于成龍，康熙感慨而言：“實乃天下廉吏第一也”。