距今約5000年前，云集著智者和賢達的神秘之島亞特蘭大陸一夜之間沉沒。大西洋底的波塞冬族向亞特蘭大陸的飛龍族發起進攻，在強大邪惡的攻勢之下，飛龍族徹底覆滅。飛龍族首領將其尚在襁褓中的兒子托付給白海豚露卡（北浜晴子 音），露卡把嬰兒藏到日本海附近的豬首岬巖洞中。最終，好心的漁夫一平（八奈見乗児 音）發現了嬰兒，將其帶回家撫養。13年后，阿龍（塩屋翼 音）已經成長一個少年。是時村中遭到海怪襲擊，阿龍在露卡的引導下找到海龜梅頓，終于從它的口中得知自己的身世。一曾迷惑的阿龍最終選擇披上紅色披風，拿起短劍，和露卡向著波塞冬族占領的大西洋進發……
　　本片根據手冢治蟲同名原著漫畫改編。